RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485478.1

LRRC17-204, Transcript of leucine rich repeat containing 17, human

TSL 3

Gene LRRC17, Length 809 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC17-204	ENST00000485478	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	ORC5	O43913	435 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CIAO1	O76071	339 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TTR	P02766	147 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TRGC1	P0CF51	173 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	OMP	P47874	163 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	MOG	Q16653	247 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	S100A7A	Q86SG5	101 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		1	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	OR51F1	A6NGY5	319 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TMEM114	B3SHH9	223 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	SERPINA7	P05543	415 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	GPX1	P07203	203 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	MSMB	P08118	114 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CTXN2	P0C2S0	81 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST1H2BO	P23527	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST1H2BB	P33778	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CEBPG	P53567	150 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST1H2BD	P58876	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	AP3S2	P59780	193 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	PSME3	P61289	254 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST1H2BC	P62807	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	NUMA1	Q14980	2115 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	DEFB119	Q8N690	84 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	OR52E6	Q96RD3	313 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	DOHH	Q9BU89	302 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CR1	P17927	2039 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	SLC22A1	O15245	554 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CRYZL1	O95825	349 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	C1QA	P02745	245 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	SHBG	P04278	402 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	UBB	P0CG47	229 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CRYGA	P11844	174 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	ERVS71-1	P61550	626 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CDK10	Q15131	360 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TMEM42	Q69YG0	159 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		0.98	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	DPRX	A6NFQ7	191 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CLPS	P04118	112 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	GPX2	P18283	190 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	CCL7	P80098	99 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	FADD	Q13158	208 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478		Q1T7F1	81 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	LCN15	Q6UWW0	184 aa		0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
LRRC17-204	ENST00000485478	TERB2	Q8NHR7	220 aa		0.97	□□□□□ -2.25

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