RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 HES1Q14469 280 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF146Q15072 292 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 WFDC1Q9HC57 220 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 RNF150Q9ULK6 438 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1W2PPE3 182 aa9.24□□□□□ -0.93
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RABGEF1-207ENST00000484547 S100A2P29034 98 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 RBP2P50120 134 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
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RABGEF1-207ENST00000484547 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.22□□□□□ -0.93
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RABGEF1-207ENST00000484547 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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RABGEF1-207ENST00000484547 DFFBO76075 338 aa9.21□□□□□ -0.93
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RABGEF1-207ENST00000484547 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.21□□□□□ -0.93
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RABGEF1-207ENST00000484547 AK3Q9UIJ7 227 aa9.21□□□□□ -0.93
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RABGEF1-207ENST00000484547 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.2□□□□□ -0.94
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RABGEF1-207ENST00000484547 H3BQ15 152 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 HSD17B6O14756 317 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 MPPED1O15442 326 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV1D-33P01593 117 aa9.2□□□□□ -0.94
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV1D-12P01611 117 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHG2P01859 326 aa9.2□□□□□ -0.94
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RABGEF1-207ENST00000484547 CEACAM6P40199 344 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 IGSF11Q5DX21 431 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 ISOC2Q96AB3 205 aa9.2□□□□□ -0.94
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