RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481098.1

GTF3C3-211, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C3, Length 547 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3-211ENST00000481098 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 OR3A4PP47883 348 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 DYNLT3P51808 116 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 CARD18P57730 90 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 RHOGP84095 191 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 Q0VG73 95 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 FAM53BQ14153 422 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 MSMO1Q15800 293 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 PMCHL1Q16048 86 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 FAM78AQ5JUQ0 283 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 Q6ZS49 121 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 MARCH3Q86UD3 253 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 ZNF695Q8IW36 515 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 TMEM123Q8N131 208 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 ZNF702PQ9H963 129 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.9□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 H0YGG7 62 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 K7EQS6 105 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SIRPB1O00241 398 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SSSCA1O60232 199 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 GYPAP02724 150 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 CTXN2P0C2S0 81 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 IGLC2P0DOY2 106 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 IGLC3P0DOY3 106 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SCGB1A1P11684 91 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 GZMHP20718 246 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 IL3RAP26951 378 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 CTRLP40313 264 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 P2RY2P41231 377 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 ERVS71-1P61550 626 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 GNB2P62879 340 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 FMODQ06828 376 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 KISS1Q15726 138 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 ZNF77Q15935 545 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 BATFQ16520 125 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 C2orf83Q53S99 150 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 Q6ZN92 141 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 Q6ZSR3 168 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 TCF24Q7RTU0 167 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 TMEM234Q8WY98 164 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 TNFRSF14Q92956 283 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 TXN2Q99757 166 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 VPS25Q9BRG1 176 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 BANF2Q9H503 90 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 RPRMQ9NS64 109 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.89□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 MYO10Q9HD67 2058 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 VWA8A3KMH1 1905 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 A0A0J9YY10 115 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 TMEM238C9JI98 176 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 H0Y980 276 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 DEGS1O15121 323 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 DHRS3O75911 302 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SERF1AO75920 110 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 OR2J2O76002 312 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 IGLV3-1P01715 115 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 CD55P08174 381 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 CRISP2P16562 243 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 OMGP23515 440 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 CCR2P41597 374 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 GABRA2P47869 451 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 CLDN18P56856 261 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SPATA45Q537H7 98 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 NMSQ5H8A3 153 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 OR10J3Q5JRS4 329 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 LCN15Q6UWW0 184 aa3.88□□□□□ -1.79
GTF3C3-211ENST00000481098 ASCL4Q6XD76 172 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms