RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472032.1

BBX-222, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-222	ENST00000472032	LCN12	Q6JVE5	192 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		Q6P435	159 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DTX2	Q86UW9	622 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ATOH7	Q8N100	152 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	WDR31	Q8NA23	367 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NEUROG1	Q92886	237 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TMEM45B	Q96B21	275 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C5orf30	Q96GV9	206 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TAAR6	Q96RI8	345 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MGST2	Q99735	147 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PKIB	Q9C010	78 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR2D2	Q9H210	308 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DNAJC13	O75165	2243 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF716	A6NP11	495 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		J3QT63	122 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		M0R1X1	148 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		M0R2Z0	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CORT	O00230	105 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SYNGR1	O43759	233 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZIC3	O60481	467 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	HSBP1	O75506	76 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NEURL1	O76050	574 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IGLV2-8	P01709	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	APCS	P02743	223 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CYC1	P08574	325 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IGLC1	P0CG04	106 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CCL5	P13501	91 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LIF	P15018	202 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	B4GALT1	P15291	398 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NTF3	P20783	257 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SSTR5	P35346	364 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	G6PC	P35575	357 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CEACAM3	P40198	252 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	GNG4	P50150	75 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	EDDM3B	P56851	147 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TMPRSS3	P57727	454 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RAC3	P60763	192 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PSG9	Q00887	426 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CFHR1	Q03591	330 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TNXA	Q16473	311 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MPV17L2	Q567V2	206 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		Q56UQ5	140 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MIC13	Q5XKP0	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PARM1	Q6UWI2	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF596	Q8TC21	504 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MBD6	Q96DN6	1003 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RNF24	Q9Y225	148 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TRANK1	O15050	2925 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-222	ENST00000472032	C5orf42	Q9H799	3197 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-222	ENST00000472032	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBX-222	ENST00000472032	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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