RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 G6PCP35575 357 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 OR1E2P47887 323 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 NUDT2P50583 147 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CRISP3P54108 245 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SYNJ2BPP57105 145 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 LCN6P62502 163 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 AKR1C1Q04828 323 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PAX8Q06710 450 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PYDC2Q56P42 97 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 LCE1FQ5T754 118 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ZNF550Q7Z398 422 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 VN1R4Q7Z5H5 301 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 TTC9CQ8N5M4 171 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 THEM6Q8WUY1 208 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 OR4K3Q96R72 315 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 NRTNQ99748 197 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 LRRC61Q9BV99 259 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CA10Q9NS85 328 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CCDC167Q9P0B6 97 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ITSN1Q15811 1721 aa3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 NWD1Q149M9 1564 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CEP350Q5VT06 3117 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 A0A087WWC5 75 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 A0A0J9YXY3 114 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 DHRS12A0PJE2 317 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 C7orf77A4D0Y5 90 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 TMEM235A6NFC5 223 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 GGT3PA6NGU5 568 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 C9JAW5 83 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ISLRO14498 428 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CDC42EP2O14613 210 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PLA2G10O15496 165 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 OR2H2O95918 312 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 BGLAPP02818 100 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 OR4A8P0C604 315 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CTSEP14091 401 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 NTF3P20783 257 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CCL1P22362 96 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 IL3RAP26951 378 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SLC25A1P53007 311 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 TPPP2P59282 170 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 LSM3P62310 102 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ZNF345Q14585 488 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ZNF79Q15937 498 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SBSNQ6UWP8 590 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 Q6ZSR6 202 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 MARCH3Q86UD3 253 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 CEND1Q8N111 149 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 DRAM1Q8N682 238 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PPTC7Q8NI37 304 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 BORCS7Q96B45 105 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 DERL3Q96Q80 235 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 LINC01587Q99440 93 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 DPY30Q9C005 99 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ACER3Q9NUN7 267 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PRNDQ9UKY0 176 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SIPA1L1O43166 1804 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 TIAM1Q13009 1591 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 LRP4O75096 1905 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.25□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 IFT172Q9UG01 1749 aa3.24□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa3.24□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 AGLP35573 1532 aa3.24□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 KIF13AQ9H1H9 1805 aa3.24□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa3.24□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 A0A0U1RQV1 116 aa3.24□□□□□ -1.89
ATRX-204ENST00000460639 A0A1B0GV50 99 aa3.24□□□□□ -1.89
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