RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NSG2Q9Y328 171 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BMPR1BO00238 502 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR2J3O76001 311 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFB8O95169 186 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV12-3P01733 135 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR13C7P0DN81 318 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLURP1P55000 103 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MFAP2P55001 183 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZRM9 215 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR2C3Q8N628 320 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRTM2Q8N967 370 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR1P1Q8NH06 330 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR52E5Q8NH55 327 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR4A16Q8NH70 328 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 THYN1Q9P016 225 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0G2JRQ6 117 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BSXQ3C1V8 233 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPHB5Q86YW7 130 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CXorf58Q96LI9 332 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC140Q96MF4 163 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCUBQ9NWR8 336 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SORL1Q92673 2214 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0B4J2A0 478 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LGALS9O00182 355 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYB5BO43169 146 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFA4P12838 97 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IL7P13232 177 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NMSQ5H8A3 153 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BATF3Q9NR55 127 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 K7EIL1 84 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 K7EIM0 57 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLA2G10O15496 165 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ST8SIA3O43173 380 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NDUFB6O95139 128 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV1-51P01701 117 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 REG1AP05451 166 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BTCP35070 178 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB25P57735 213 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPCS3P61009 180 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRPXP78539 464 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DEFA5Q01523 94 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TATDN3Q17R31 274 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM16LQ309B1 348 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR146Q96CH1 333 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 F8W735 103 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 I3L2K1 104 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PITX3O75364 302 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLEC3BP05452 202 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A6P12236 298 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AKR1C2P52895 323 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TXN2Q99757 166 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC32Q9BV29 185 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A8MWP6 167 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSN3P07498 182 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ANXA3P12429 323 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AKR1C4P17516 323 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCR6P51684 374 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYNJ2BPP57105 145 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPEL1Q2QD12 228 aa8.54□□□□□ -1.04
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