RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM128Q5BJH2 165 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 LHFPL5Q8TAF8 219 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 TRBV12-3P01733 135 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 SRPXP78539 464 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 TATDN3Q17R31 274 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 AARDQ4LEZ3 155 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM268Q5VZI3 342 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2C3Q8N628 320 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 VN1R17PQ8TDU5 208 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0G2JRQ6 117 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 ST8SIA3O43173 380 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 ERHP84090 104 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A24Q6NUK1 477 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 ACSM6Q6P461 480 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 Q6ZRM9 215 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 TMED4Q7Z7H5 227 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 LGI3Q8N145 548 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF114Q8NC26 417 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1P1Q8NH06 330 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52E5Q8NH55 327 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 S100ZQ8WXG8 99 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC32Q9BV29 185 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 PTTG2Q9NZH5 202 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0B4J2A0 478 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 BMPR1BO00238 502 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFB6O95139 128 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNA17P01571 189 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP10-11P60412 298 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 RPEL1Q2QD12 228 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR146Q96CH1 333 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6V0BQ99437 205 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 PDCD10Q9BUL8 212 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 SHPKQ9UHJ6 478 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CCR6P51684 374 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 MFAP2P55001 183 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 SPCS3P61009 180 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CENPSQ8N2Z9 138 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35G3Q8N808 338 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 LRTM2Q8N967 370 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF502Q8TBZ5 544 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC140Q96MF4 163 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 ELOVL1Q9BW60 279 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 PLA2G10O15496 165 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 SFT2D2O95562 160 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC3BP05452 202 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 SYNJ2BPP57105 145 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 OR9G4Q8NGQ1 327 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 OR4C12Q96R67 309 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 CACNG5Q9UF02 275 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGEF1-204ENST00000442563 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 BTCP35070 178 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 NMSQ5H8A3 153 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 PVRIGQ6DKI7 326 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 LYZL2Q7Z4W2 148 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 GPHB5Q86YW7 130 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR13Q9NZ81 148 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EIM0 57 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SAP30O75446 220 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV3-23P01764 117 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SULT1A3P0DMM9 295 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SULT1A4P0DMN0 295 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 VAMP1P23763 118 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 ARL3P36405 182 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SNCAP37840 140 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R1AQ13522 171 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SCARB1Q8WTV0 552 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 ENY2Q9NPA8 101 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 PEMTQ9UBM1 199 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 S4R3C0 116 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1B0GU03 582 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP5D1E7EU14 171 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 LGALS9O00182 355 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 LYRM1O43325 122 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2C1O95371 312 aa12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGEF1-204ENST00000442563 SMCO1Q147U7 214 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms