RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 VSIG8P0DPA2 414 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LGALS4P56470 323 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 GLIPR2Q9H4G4 154 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 RNF115Q9Y4L5 304 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PPYP01298 95 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 COL9A1P20849 921 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF721Q8TF20 911 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 OOSP1A8MZH6 123 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PPLO60437 1756 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MPDZO75970 2070 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0556O60303 1618 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF815PA8K554 130 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CTRLP40313 264 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN2P57739 230 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 Q8TCH9 128 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 KIF1AQ12756 1690 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 GPHA2Q96T91 129 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 Q6Q795 121 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 IL17RELQ6ZVW7 336 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CFHR4Q92496 578 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 CNTFRP26992 372 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SSR4P51571 173 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZSR6 202 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM86BQ8N661 226 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 RNF182Q8N6D2 247 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 FGF11Q92914 225 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf92Q96LL3 132 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 B9D1Q9UPM9 204 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 KNTC1P50748 2209 aa4.67□□□□□ -1.66
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