RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 APOA2P02652 100 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 OR5G3P0C626 314 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 CD33P20138 364 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 RAB4BP61018 213 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRBP23467 1997 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.162e-9■■□□□ 14.4
TTLL3-210ENST00000427220 CRYBB3P26998 211 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 TUBG2Q9NRH3 451 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM106BQ9NUM4 274 aa16.04■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 SMIM6P0DI80 62 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 Q8N7P7 452 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 MISP3Q96FF7 219 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 B4DEV8 164 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 PHOX2AO14813 284 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 KIR3DL3Q8N743 410 aa16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 FCN3O75636 299 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC10Q5BKY1 277 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 OCC1Q8TAD7 63 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 S4R3C0 116 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 CNTFRP26992 372 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 DDB2Q92466 427 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 NABP2Q9BQ15 211 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 CTSZQ9UBR2 303 aa16.02■□□□□ 0.16
TTLL3-210ENST00000427220 GCHFRP30047 84 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 LINC00479Q96M42 142 aa16.02■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 E7EQL1 145 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 MOSP00540 346 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 ORM2P19652 201 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 PRR27Q6MZM9 219 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 BLNKQ8WV28 456 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 MALSU1Q96EH3 234 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 C1orf159Q96HA4 380 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CXorf65A6NEN9 183 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CGB3P0DN86 165 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CGB7P0DN87 165 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TBR1Q16650 682 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 LINC01551Q86U37 167 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 NPIPB3Q92617 1050 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa16.01■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF90Q03938 601 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 GAMTQ14353 236 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM250H0YL14 139 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 RHOBP62745 196 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 MORN5Q5VZ52 161 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 UPK2O00526 184 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CXorf1O96002 111 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 PYYP10082 97 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 ERVFC1-1P60608 527 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 SSTP61278 116 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 PLGLAQ15195 96 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 HIST3H2BBQ8N257 126 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TCEAL7Q9BRU2 100 aa16■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TRAV34A0A0B4J273 112 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 PFN1P07737 140 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CFHR2P36980 270 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CACNA1AO00555 2505 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM178BH3BS89 294 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CA1P00915 261 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CBLN1P23435 193 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 PMS2P11Q13670 270 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TNXAQ16473 311 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 LEMD1Q68G75 181 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 PRNDQ9UKY0 176 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.99■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 VSTM5A8MXK1 200 aa15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA1644Q3SXP7 199 aa15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM14BQ9NUH8 114 aa15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 RAXQ9Y2V3 346 aa15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 KIR2DS2P43631 304 aa15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 IL3RAP26951 378 aa15.98■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 KCNIP4Q6PIL6 250 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 ONECUT1Q9UBC0 465 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CCL21O00585 134 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 STAG3L2P0CL84 134 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms