RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.22□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.22□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 WSB1Q9Y6I7 421 aa8.22□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 CORTO00230 105 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 P0C879 139 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 UQCRFS1P47985 274 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF266Q14584 549 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 C4orf17Q53FE4 359 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF738Q8NE65 137 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 COX11Q9Y6N1 276 aa8.21□□□□□ -1.09
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB29O14966 203 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 FCN3O75636 299 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SULT1A2P50226 295 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 DYNLT3P51808 116 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ELOBQ15370 118 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 PSG3Q16557 428 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM177Q53S58 311 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ODF3L1Q8IXM7 274 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF714Q96N38 554 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 S1PR3Q99500 378 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 GINS3Q9BRX5 216 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 PSENENQ9NZ42 101 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 CTSZQ9UBR2 303 aa8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 H0Y8G0 127 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ZG16O60844 167 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SEC11BP0C7V7 166 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 CCL3L1P16619 93 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 GNLYP22749 145 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ID1P41134 155 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 PPOXP50336 477 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TDRG1Q3Y452 100 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 MIDNQ504T8 468 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF343Q6P1L6 599 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.2□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SCGB1D1O95968 90 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 LYNX1P0DP58 116 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SCGB1A1P11684 91 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 KIR2DS2P43631 304 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 MMDQ15546 238 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 RBKSQ9H477 322 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 LRBAP50851 2863 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 COL8A2P25067 703 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TAS2R30P59541 319 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ERVK-16P61578 105 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP5SQ99766 215 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 THBS3P49746 956 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB31Q13636 194 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 Q6ZRG5 221 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TCF24Q7RTU0 167 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 DDB2Q92466 427 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF727A8MUV8 499 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 PSG1P11464 419 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP6V0CP27449 155 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP5J2P56134 94 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB39BQ96DA2 213 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SFRP2Q96HF1 295 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 PARP11Q9NR21 331 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.18□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 UMAD1C9J7I0 102 aa8.17□□□□□ -1.1
LRRTM4-202ENST00000409093 PRH1P02810 166 aa8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms