RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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TOMM40-201ENST00000252487 OR5T1Q8NG75 326 aa20.52■□□□□ 0.88
TOMM40-201ENST00000252487 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
TOMM40-201ENST00000252487 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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TOMM40-201ENST00000252487 P2RX4Q99571 388 aa20.5■□□□□ 0.87
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TOMM40-201ENST00000252487 TSC22D2O75157 780 aa20.49■□□□□ 0.87
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TOMM40-201ENST00000252487 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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TOMM40-201ENST00000252487 CTRB2Q6GPI1 263 aa20.48■□□□□ 0.87
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TOMM40-201ENST00000252487 C19orf54Q5BKX5 351 aa20.47■□□□□ 0.87
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TOMM40-201ENST00000252487 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
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TOMM40-201ENST00000252487 TMEM217Q8N7C4 229 aa20.47■□□□□ 0.87
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TOMM40-201ENST00000252487 Q8N2B8 174 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-201ENST00000252487 TTC9CQ8N5M4 171 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-201ENST00000252487 HYLS1Q96M11 299 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-201ENST00000252487 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa20.46■□□□□ 0.87
TOMM40-201ENST00000252487 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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TOMM40-201ENST00000252487 OR8U8P0C7N1 319 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 C10orf99Q6UWK7 81 aa20.45■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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TOMM40-201ENST00000252487 CRYGCP07315 174 aa20.44■□□□□ 0.86
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TOMM40-201ENST00000252487 C2orf83Q53S99 150 aa20.44■□□□□ 0.86
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TOMM40-201ENST00000252487 PMS2P5A8MQ11 134 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 HMSDA8MTL9 139 aa20.44■□□□□ 0.86
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TOMM40-201ENST00000252487 ZNF329Q86UD4 541 aa20.44■□□□□ 0.86
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TOMM40-201ENST00000252487 SMIM3Q9BZL3 60 aa20.44■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa20.43■□□□□ 0.86
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TOMM40-201ENST00000252487 ETV3LQ6ZN32 361 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 MISP3Q96FF7 219 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa20.43■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 LY86O95711 162 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 IGHV3-48P01763 117 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 SULT1A1P50225 295 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 RPP30P78346 268 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 MLANAQ16655 118 aa20.42■□□□□ 0.86
TOMM40-201ENST00000252487 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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