RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

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Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PSMB3P49720 205 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 STPG3Q8N7X2 389 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 TVP23CQ96ET8 276 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 MANBALQ9NQG1 85 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1W2PPV4 95 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 RAB31Q13636 194 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 GAMTQ14353 236 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 RPEQ96AT9 228 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 M0R1W7 72 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PRR20EP86478 221 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PRR20CP86479 221 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PRR20DP86480 221 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PRR20BP86481 221 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PRR20AP86496 221 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 CD69Q07108 199 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 ISOC2Q96AB3 205 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 LINC00869P0C866 280 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PSG5Q15238 335 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1W2PPI3 338 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PAGE4O60829 102 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PRSS8Q16651 343 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 HCP5Q6MZN7 132 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 STAG3L2P0CL84 134 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 STAG3L3P0CL85 134 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 EFNA4P52798 201 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 IGSF10Q6WRI0 2623 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 CRYBA1P05813 215 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PRTN3P24158 256 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 MMD2Q8IY49 270 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 A0A087WWC5 75 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM250H0YL14 139 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 HTR1DP28221 377 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 KLRD1Q13241 179 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.83□□□□□ -0.03
HOXC11-201ENST00000243082 PLXNB1O43157 2135 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 OR4F5Q8NH21 305 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 OR4F4Q96R69 305 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 DPM3Q9P2X0 92 aa14.83□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ACACBO00763 2458 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF727A8MUV8 499 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 ODF3BA8MYP8 253 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 OR10J1P30954 320 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 TNXAQ16473 311 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 YPEL4Q96NS1 127 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 TIMM23O14925 209 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 OR2C1O95371 312 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 CXorf1O96002 111 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 MT-ND4LP03901 98 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 REG1AP05451 166 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 MAS1LP35410 378 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 RHOBP62745 196 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 RNF5Q99942 180 aa14.82□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 C11orf94C9JXX5 98 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 IGHV2-5P01817 119 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FOLR2P14207 255 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FAM24BQ8N5W8 94 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 FBXL15Q9H469 300 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 MLXQ9UH92 298 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 B4DEV8 164 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 OVOL3O00110 214 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 VENTXO95231 258 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXC11-201ENST00000243082 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.8□□□□□ -0.04
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