RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000068056.11

Ddx39b-201, Transcript of Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ddx39b, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cnn3Q9DAW9 330 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa14.56□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 TnxbO35452 4006 aa14.56□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ighv1-7A0A075B5T7 117 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Trbv23A0A0A6YWQ1 115 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rhox2fA2ANE0 191 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm16434J3QN10 205 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 4930555G01RikL7N253 205 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hes1P35428 282 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fndc4Q3TR08 231 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ppp5cQ60676 499 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rpl35Q6ZWV7 123 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lcn10Q810Z1 182 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cept1Q8BGS7 416 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Smim4Q8C1Q6 80 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Anapc10Q8K2H6 185 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc35b3Q922Q5 369 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sntg1Q925E1 517 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 GhsrQ99P50 364 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lyrm1Q9CQB7 122 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ptges3lQ9D9A7 131 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hnf4gQ9WUU6 408 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1700025C18RikA2A580 89 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hacd4A2AKM2 232 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm6614M0QWR8 670 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 GrprP21729 384 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rab17P35292 214 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Srp9P49962 86 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hsd11b1P50172 292 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 F7P70375 446 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc38a8Q5HZH7 432 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dio1Q61153 257 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr876Q7TRE4 310 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mapk1ip1lQ8BH93 242 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam24aQ8CF27 98 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Raet1eQ9CZQ6 251 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Slc25a22Q9D6M3 323 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Btbd17Q9DB72 478 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Acot12Q9DBK0 556 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Stra6lQ9DBN1 621 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Nqo2Q9JI75 231 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccl24Q9JKC0 119 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fbxw4Q9JMJ2 410 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Anxa10Q9QZ10 324 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Clec4dQ9Z2H6 219 aa14.55□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ankdd1aA0A1L1ST07 508 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm5286E0CXI6 357 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Lynx1P0DP60 116 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ccl2P10148 148 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gpr55Q3UJF0 327 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ifna15Q61718 190 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ypel2Q65Z95 119 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1126Q7TR49 314 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ncs1Q8BNY6 190 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Esco2Q8CIB9 592 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Q9CWB7 115 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Cir1Q9DA19 450 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ssr3Q9DCF9 185 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ypel1Q9ESC7 118 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tinf2Q9QXG9 341 aa14.54□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1700031F05RikB1AX30 191 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Spink14B9EJP9 96 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Olfr1329L7MTV4 313 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Dnase1P49183 284 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vbp1P61759 196 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Anxa7Q07076 463 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm4792Q569Q2 183 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 HepacamQ640R3 418 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Arhgap22Q8BL80 702 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tmem212Q8C6V3 187 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 GaptQ8CB93 157 aa14.53□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ighv14-2A0A075B5R7 117 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm3512L7N206 146 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 BlcapP62951 87 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zdhhc23Q5Y5T3 425 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 SrmQ64674 302 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fam122bQ6NZE7 255 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Fblim1Q71FD7 375 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Zim1Q8C393 579 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mrps23Q8VE22 177 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 MetrnlQ8VE43 311 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Irak1bp1Q9ESJ7 259 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Hivep3A2A884 2348 aa14.52□□□□□ -0.08
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gsg1lD3Z7H4 322 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Gm5093E9PZB3 174 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Rplp1P47955 114 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Tgm6Q8BM11 706 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Mrps24Q9CQV5 167 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Ifitm3Q9CQW9 137 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Iqcf5Q9DAL7 148 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Sectm1bQ9JL59 212 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Bex1Q9R224 128 aa14.52□□□□□ -0.09
Ddx39b-201ENSMUST00000068056 Brwd1Q921C3 2304 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 91.6 ms