RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL28Q9NRJ3 127 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS13DQ5THJ4 4388 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM235A6NFC5 223 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLL5B9A064 214 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 UPK2O00526 184 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TCTAP57738 103 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SPSB3Q6PJ21 355 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 GDPD1Q8N9F7 314 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRDL1Q9BU40 450 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA10Q9UJ72 324 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 XRCC3O43542 346 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13C7P0DN81 318 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 DMBX1Q8NFW5 382 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 C21orf62Q9NYP8 219 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT1C2O00338 296 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 NQO2P16083 231 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R31P59538 309 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ARPC4P59998 168 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 Q56UQ5 140 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM140Q9NV12 185 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM30A4D0T7 59 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EMT4 169 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CA1P00915 261 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CATR1Q13166 79 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF2Q99496 336 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 HINT2Q9BX68 163 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAH6Q9C0G6 4158 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 EBAG9O00559 213 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 HPRT1P00492 218 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC2P0DI81 140 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC2BP0DI82 140 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MFAP2P55001 183 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13F1Q8NGS4 319 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP21Q9H596 190 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SMPXQ9UHP9 88 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FCGR2CP31995 323 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 CMTM3Q96MX0 182 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 APLNQ9ULZ1 77 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf62A8K5M9 175 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 YIF1AO95070 293 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINE2P07093 398 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ADMP35318 185 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 WT1-ASQ06250 92 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GBGT1Q8N5D6 347 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51H1Q8NH63 302 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SCARB1Q8WTV0 552 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A7Q9GZV3 580 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SSX5O60225 188 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 FXYD4P59646 89 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM187Q14656 261 aa20.02■□□□□ 0.8
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CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00336Q6ZUF6 198 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM116Q8NCL8 245 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB34Q8NCN2 500 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa20.01■□□□□ 0.79
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CAPNS1-217ENST00000629983 PTHLHP12272 177 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-16P61578 105 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 POU2AF1Q16633 256 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 AADACL3Q5VUY0 350 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1L8Q8NGR8 309 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ETV7Q9Y603 341 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf94C9JXX5 98 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SCGNO76038 276 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PPYP01298 95 aa20■□□□□ 0.79
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CAPNS1-217ENST00000629983 C22orf42Q6IC83 251 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NR2C2APQ86WQ0 139 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 GVQW1Q8N7I0 195 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 BEST4Q8NFU0 473 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V0BQ99437 205 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF367Q7RTV3 350 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 F8W735 103 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PAFAH1B2P68402 229 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM17Q86X19 198 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHA2Q9HB19 425 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EIM0 57 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF2P09038 288 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF773Q6PK81 442 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPSQ8N2Z9 138 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFB11Q9NX14 153 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 COMMD9Q9P000 198 aa19.97■□□□□ 0.79
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