RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623267.3

SNHG5-216, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, human

TSL 5

Gene SNHG5, Length 374 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG5-216	ENST00000623267	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PRSS8	Q16651	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	HAGH	Q16775	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	RNF212	Q495C1	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SSX3	Q99909	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	THYN1	Q9P016	225 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	OVOL3	O00110	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SLC25A17	O43808	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TOX4	O94842	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	VENTX	O95231	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	DEFA4	P12838	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	IGFBP2	P18065	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	REG1B	P48304	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	UBE2E1	P51965	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	BPIFB3	P59826	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CCL20	P78556	96 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CD69	Q07108	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PSG5	Q15238	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TNXA	Q16473	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SPINK9	Q5DT21	86 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	NPB	Q8NG41	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CCL19	Q99731	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	RARRES2	Q99969	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	MLX	Q9UH92	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267		A0A1B0GV50	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267		H3BQ15	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	NBR2	O15453	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	SCO1	O75880	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	GATA3	P23771	443 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	COX7A1	P24310	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	S100P	P25815	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CEBPG	P53567	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	RAB5B	P61020	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	PAX2	Q02962	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	GAMT	Q14353	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	HES1	Q14469	280 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	ICAM4	Q14773	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CDSN	Q15517	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	MMD	Q15546	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNHG5-216	ENST00000623267	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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