RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597297.1

PDE4C-210, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-210ENST00000597297 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 INSIG2Q9Y5U4 225 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 KPTNQ9Y664 436 aa9.5□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 ODF3BA8MYP8 253 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 HTR1DP28221 377 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 LGALS7P47929 136 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 F2RL1P55085 397 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 PAX2Q02962 417 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 KLRD1Q13241 179 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 VWC2Q2TAL6 325 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 MOB3BQ86TA1 216 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 OR5B3Q8NH48 314 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 HINT2Q9BX68 163 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 HRH4Q9H3N8 390 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 TNCP24821 2201 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 A0A1W2PPI3 338 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 ZP3P21754 424 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 CEACAM3P40198 252 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 FHITP49789 147 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 RAB11AP62491 216 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 ZNF616Q08AN1 781 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 UQCC3Q6UW78 93 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 SLC24A4Q8NFF2 622 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 RSG1Q9BU20 258 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 SIRPDQ9H106 197 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 DPM3Q9P2X0 92 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 RRHO14718 337 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 SLC25A17O43808 307 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 CD5LO43866 347 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 FOXH1O75593 365 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 OPN1MWP04001 364 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 NPY1RP25929 384 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 RITA1Q96K30 269 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00052Q96N35 136 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 PRSS46E5RG02 174 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 TSPAN15O95858 294 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 TEX45Q8NA69 505 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 GGACTQ9BVM4 153 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PDE4C-210ENST00000597297 HIVEP2P31629 2446 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 FAM157AC9JC47 383 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 TIMM23O14925 209 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 CA2P00918 260 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 IFNA4P05014 189 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 FGF7P21781 194 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 DLK1P80370 383 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 SERF2P84101 59 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 PSG5Q15238 335 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 COMMD1Q8N668 190 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 RNF5Q99942 180 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.45□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 A0A1W2PN81 502 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 A0A1W2PRD5 423 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 A0A1W2PRF3 423 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 A0A1W2PRM7 423 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4C-210ENST00000597297 INAFM1C9JVW0 142 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms