RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 OR1L8Q8NGR8 309 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 OR52E5Q8NH55 327 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCD10Q9BUL8 212 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 AP4M1O00189 453 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GNB1P62873 340 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 DEFB121Q5J5C9 76 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 Q6ZNX1 250 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2T6Q8NHC8 308 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM68Q96MH6 324 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPB9Q9BQS6 159 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 OR51B2Q9Y5P1 312 aa18.54■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 IGF1P05019 195 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 OR2B8PP59922 312 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GSG1LQ6UXU4 331 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 Q6ZRM9 215 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 MED28Q9H204 178 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 NSG2Q9Y328 171 aa18.53■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 PITX3O75364 302 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5M8Q8NGP6 311 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 OR1S1Q8NH92 325 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 GON7Q9BXV9 100 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SPCS3P61009 180 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CD69Q07108 199 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ABHD5Q8WTS1 349 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PARP11Q9NR21 331 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 RYR2Q92736 4967 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 C5orf51A6NDU8 294 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 GOSR2O14653 212 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP6V0E1O15342 81 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ST8SIA3O43173 380 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CYCSP99999 105 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NDPQ00604 133 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PRCDQ00LT1 54 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHDC1Q8N7A1 406 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 GRPEL2Q8TAA5 225 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf50Q96LR7 162 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPB7Q9UBY9 170 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PN81 502 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CCSO14618 274 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 IFNA17P01571 189 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CHRNA7P36544 502 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 AKIRIN2Q53H80 203 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 Q6ZS46 218 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 OR4F17Q8NGA8 305 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ASB13Q8WXK3 278 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 OR10C1Q96KK4 312 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 OR4F4Q96R69 305 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 MGAT4CQ9UBM8 478 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TENM2Q9NT68 2774 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TNCP24821 2201 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 MPTX1A8MV57 137 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM25EA8MYX2 175 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 INS-IGF2F8WCM5 200 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 MED6O75586 246 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 LY86O95711 162 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 C10orf55Q5SWW7 151 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 OR4D5Q8NGN0 318 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 B9D2Q9BPU9 175 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 MSGN1A6NI15 193 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF9Q07011 255 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 STPG2Q8N412 459 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 WFDC9Q8NEX5 89 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHA3Q9HB20 300 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFP57Q9NU63 452 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAV41A0A0B4J266 112 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX22C9J3V5 150 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 NMES1Q9C002 83 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 ENY2Q9NPA8 101 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 SERTAD4Q9NUC0 356 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO7Q9Y3I1 522 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPNS1-214ENST00000592483 CGB1A6NKQ9 187 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01548A6NM66 108 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-214ENST00000592483 MYOD1P15172 320 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.6 ms