RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 ERVS71-1P61550 626 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CCL20P78556 96 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 HNF4GQ14541 408 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 POU2AF1Q16633 256 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 DNLZQ5SXM8 178 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 LCN15Q6UWW0 184 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 Q6ZR03 302 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 SSX9Q7RTT3 188 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CD177Q8N6Q3 437 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 OR4A5Q8NH83 315 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 VSTM2AQ8TAG5 236 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 NPIPB3Q92617 1050 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CYYR1Q96J86 154 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 OR2V2Q96R30 315 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 RNF2Q99496 336 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CALYQ9NYX4 217 aa3.7□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 USF3Q68DE3 2245 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 WNT9BO14905 357 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 SIGLEC5O15389 551 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 FSTL3O95633 263 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 IGHV2-5P01817 119 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 DAOP14920 347 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 IL3RAP26951 378 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CEBPGP53567 150 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 CASP6P55212 293 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 EDDM3BP56851 147 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 LCN2P80188 198 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 ELOBQ15370 118 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 C12orf57Q99622 126 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-215ENST00000583289 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRM-215ENST00000583289 DOK5Q9P104 306 aa3.69□□□□□ -1.82
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