RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 NECAP1Q8NC96 275 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR4A5Q8NH83 315 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.38□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 FAM223BA6NKX1 122 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 DBX1A6NMT0 343 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 RGS5O15539 181 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 PI3P19957 117 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 RCVRNP35243 200 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 LAX1Q8IWV1 398 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.37□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 DEFA4P12838 97 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 MFAP2P55001 183 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 UCP3P55916 312 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 WT1-ASQ06250 92 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 KLK9Q2XQG4 91 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 AP3S1Q92572 193 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 HINT2Q9BX68 163 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 MARCH11A6NNE9 402 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IFNA6P05013 189 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CLEC3BP05452 202 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SERPINE2P07093 398 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR13C7P0DN81 318 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 KIR3DS1Q14943 382 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TATDN3Q17R31 274 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 BORCS5Q969J3 196 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SEC22AQ96IW7 307 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 COMMD9Q9P000 198 aa7.35□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF785A8K8V0 405 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 PGAM2P15259 253 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 ARL3P36405 182 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 RPL5P46777 297 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TMBIM6P55061 237 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 ERVK-16P61578 105 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SP6Q3SY56 376 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TP53RKQ96S44 253 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-211ENST00000581536 TENM3Q9P273 2699 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF320A2RRD8 509 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 C2orf70A6NJV1 201 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 H3BMQ9 156 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 GABARAPH6UMI1 98 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SNAPC5O75971 98 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 RAB3DO95716 219 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CD74P04233 296 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 FOLR2P14207 255 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 PPP5CP53041 499 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 PIGPP57054 158 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-211ENST00000581536 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.33□□□□□ -1.24
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