RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MOB3BQ86TA1 216 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CACNA1AO00555 2505 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 FLNCQ14315 2725 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 NAV3Q8IVL0 2385 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFHX3Q15911 3703 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 E7EUB6 86 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR8U8P0C7N1 319 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 UQCRFS1P47985 274 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 VWC2Q2TAL6 325 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PFDN5Q99471 154 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1W2PPR1 153 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 YIF1AO95070 293 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV2-70P01814 119 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PAX6P26367 422 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERF2P84101 59 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MLANAQ16655 118 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CA2P00918 260 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD1BP29016 333 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIR2DS2P43631 304 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELOBQ15370 118 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TREML4Q6UXN2 200 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TUBA4BQ9H853 241 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MED13LQ71F56 2210 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 H0YJW9 148 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 J3QR06 171 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFS8O00217 210 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFNA4P05014 189 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SOD3P08294 240 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 BCL2P10415 239 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF212Q495C1 297 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 LHX4Q969G2 390 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB9BQ9NP90 201 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 BTBD17A6NE02 478 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMIM6P0DI80 62 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATP6V1FQ16864 119 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLEC12BQ2HXU8 276 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSX8Q7RTT4 187 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR52E5Q8NH55 327 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TVP23CQ96ET8 276 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MGST2Q99735 147 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 UPK2O00526 184 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2CO00762 179 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYB5BO43169 146 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 LY86O95711 162 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 HNF1AP20823 631 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MIC13Q5XKP0 118 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB24Q969Q5 203 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SOX15O60248 233 aa8.23□□□□□ -1.09
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