RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 BTRCQ9Y297 605 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 UFC1Q9Y3C8 167 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 NBASA2RRP1 2371 aa3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 DHRS12A0PJE2 317 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TVP23AA6NH52 213 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 HMSDA8MTL9 139 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PEX7O00628 323 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SCELO95171 688 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MT-ND4P03905 459 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR5G3P0C626 314 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CD99P14209 185 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MGMTP16455 207 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CXCL2P19875 107 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GADD45AP24522 165 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 NFYBP25208 207 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TAS2R43P59537 309 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 S100A10P60903 97 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 UBE2KP61086 200 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 FABP5Q01469 135 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PAX5Q02548 391 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TPBGQ13641 420 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TNXAQ16473 311 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 DEFB110Q30KQ9 67 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PYDC2Q56P42 97 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 FAM78BQ5VT40 261 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 C22orf42Q6IC83 251 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR10K2Q6IF99 312 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 FAHD1Q6P587 224 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 WDR82Q6UXN9 313 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 H2AFVQ71UI9 128 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 NIT1Q86X76 327 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SLC35G3Q8N808 338 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR4K2Q8NGD2 314 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR51Q1Q8NH59 317 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 IL22RA2Q969J5 263 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ISOC2Q96AB3 205 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GPR146Q96CH1 333 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PYURFQ96I23 114 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 LYSMD1Q96S90 227 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ATP5SQ99766 215 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 DUSP21Q9H596 190 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PSG8Q9UQ74 426 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 FBN2P35556 2912 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 A0A0D9SG52 128 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 F6UB75 175 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR2J3O76001 311 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR2F2O95006 317 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SERPINE2P07093 398 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SOD3P08294 240 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PIRTP0C851 137 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SMIM17P0DL12 118 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 OR5H8P0DN80 308 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ESDP10768 282 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 AZU1P20160 251 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 IMPA1P29218 277 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TGFBR1P36897 503 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 CFHR2P36980 270 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 STC1P52823 247 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 GNG3P63215 75 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SLC35A2P78381 396 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 BTG2P78543 158 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ST3GAL4Q11206 333 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 BATFQ16520 125 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 SPIN4Q56A73 249 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM128Q5BJH2 165 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 PDZD11Q5EBL8 140 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms