RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CREBBPQ92793 2442 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTPRB-209ENST00000550857 SIX6O95475 246 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 MELTFP08582 738 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF56Q15929 161 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 CTF1Q16619 201 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRB-209ENST00000550857 SPINK9Q5DT21 86 aa6.68□□□□□ -1.34
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