RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 BTNL8Q6UX41 500 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 OR52E5Q8NH55 327 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PARP11Q9NR21 331 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 RPRMQ9NS64 109 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 MED9Q9NWA0 146 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.78□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 IGKV1-33P01594 117 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IGLV2-23P01705 113 aa6.78□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 M0R1W7 72 aa6.78□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 AARDQ4LEZ3 155 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 ZNF787Q6DD87 383 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 HCP5Q6MZN7 132 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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CS-215ENST00000549143 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 OR5B3Q8NH48 314 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PPI3 338 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FCN1O00602 326 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 RAB5CP51148 216 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 RAB2AP61019 212 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.77□□□□□ -1.32
CS-215ENST00000549143 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.77□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 LGALS7P47929 136 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PPT1P50897 306 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-9P60411 292 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 WT1-ASQ06250 92 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 HAGHQ16775 308 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 FBLN7Q53RD9 439 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.77□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 C9JQL5 133 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 F8W036 122 aa6.77□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 CNIH1O95406 144 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PSG5Q15238 335 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.77□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.76□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 TMEM218A2RU14 115 aa6.76□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 FOXH1O75593 365 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 VENTXO95231 258 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ZP3P21754 424 aa6.76□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 TREML4Q6UXN2 200 aa6.76□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.76□□□□□ -1.33
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CS-215ENST00000549143 KPTNQ9Y664 436 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ZFP92A6NM28 416 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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