RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520808.6

NPIPB4-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 4

Gene NPIPB4, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CCL20	P78556	96 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DLK1	P80370	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ICAM4	Q14773	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LTC4S	Q16873	150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF429	Q86V71	674 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LHX4	Q969G2	390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RARRES2	Q99969	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TGOLN2	O43493	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NDUFA2	O43678	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	IFNA10	P01566	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TFF1	P04155	84 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	S100A6	P06703	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR4A8	P0C604	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DAO	P14920	347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	CD1B	P29016	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MAS1L	P35410	378 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PSMB3	P49720	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ATP5J2	P56134	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB31	Q13636	194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DDB2	Q92466	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RAB1C	Q92928	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808		A0A1W2PPV4	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NDUFB3	O43676	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	PROP1	O75360	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	OR2C1	O95371	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	APOA2	P02652	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	GYPA	P02724	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	ARG1	P05089	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NPIPB4-205	ENST00000520808	NDUFB7	P17568	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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