RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CBLN1P23435 193 aa22.21■■□□□ 1.15
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-221ENST00000511747 MS4A10Q96PG2 267 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB4BP61018 213 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-221ENST00000511747 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-221ENST00000511747 C11orf52Q96A22 123 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-221ENST00000511747 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa22.21■■□□□ 1.15
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SH3BP2-221ENST00000511747 ACTL6BO94805 426 aa22.2■■□□□ 1.15
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR51B2Q9Y5P1 312 aa22.2■■□□□ 1.15
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SH3BP2-221ENST00000511747 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.19■■□□□ 1.14
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SH3BP2-221ENST00000511747 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa22.17■■□□□ 1.14
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF439Q8NDP4 499 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-221ENST00000511747 DEFB108BQ8NET1 73 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-221ENST00000511747 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC45A2Q9UMX9 530 aa22.17■■□□□ 1.14
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SH3BP2-221ENST00000511747 FNDC10F2Z333 226 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-221ENST00000511747 ERVFC1-1P60608 527 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5I1Q13606 314 aa22.16■■□□□ 1.14
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SH3BP2-221ENST00000511747 GCM1Q9NP62 436 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-221ENST00000511747 HELTA6NFD8 242 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-221ENST00000511747 CD33P20138 364 aa22.15■■□□□ 1.14
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SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa22.14■■□□□ 1.14
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR1L6Q8NGR2 347 aa22.13■■□□□ 1.13
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SH3BP2-221ENST00000511747 V9GYV3 84 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 DSCAML1Q8TD84 2053 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 CT45A6P0DMU7 189 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 CT45A5P0DMU8 189 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 CT45A7P0DMV0 189 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 IER3P46695 156 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC00310P59036 64 aa22.13■■□□□ 1.13
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