RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 CHP2O43745 196 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IFNA4P05014 189 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ASAH2BP0C7U1 165 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CTLA4P16410 223 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CEACAM3P40198 252 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 KIR3DL2P43630 455 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RAP1BP61224 184 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 SELENOTP62341 195 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RAP1AP62834 184 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CAV1Q03135 178 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 OTPQ5XKR4 325 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 LCN8Q6JVE9 175 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 SSX7Q7RTT5 188 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CALHM1Q8IU99 346 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.15□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RNF126Q9BV68 326 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 OR51J1Q9H342 316 aa3.15□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 A0A0G2JRQ6 117 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 C17orf98A8MV24 154 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 LINC01619G3V211 115 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 H7C1C5 153 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 K7EN84 100 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 M0R2N4 97 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 NME4O00746 187 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 XKRYO14609 159 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 RAB3DO95716 219 aa3.14□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 RAB5AP20339 215 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 ALDH3A1P30838 453 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 MAGEA2P43356 314 aa3.14□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 DNAJB13P59910 316 aa3.14□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.14□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 SNX12Q9UMY4 172 aa3.14□□□□□ -1.91
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PDE4D-217ENST00000509355 OR5H8P0DN80 308 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 PSG2P11465 335 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TCP1P17987 556 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-217ENST00000509355 TCTAP57738 103 aa3.13□□□□□ -1.91
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