RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502394.1

MATR3-231, Transcript of matrin 3, human

TSL 4

Gene MATR3, Length 589 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-231	ENST00000502394	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	DTD1	Q8TEA8	209 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	SMIM8	Q96KF7	97 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	PLXNB1	O43157	2135 aa		9.64	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	MSGN1	A6NI15	193 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	TEX22	C9J3V5	150 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	WRB	O00258	174 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	LY86	O95711	162 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CA2	P00918	260 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	IFNA17	P01571	189 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	IGHV4-59	P01825	116 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	HKR1	P10072	659 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	IAPP	P10997	89 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CXCL2	P19875	107 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	HNF1A	P20823	631 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	NDP	Q00604	133 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	SPINK9	Q5DT21	86 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF546	Q86UE3	836 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM219	Q86XT9	240 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OR5R1	Q8NH85	324 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	DCUN1D4	Q92564	292 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	AQP10	Q96PS8	301 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	HIVEP1	P15822	2718 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	TSC22D2	O75157	780 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CX3CL1	P78423	397 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF345	Q14585	488 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	TNXA	Q16473	311 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	LY6E	Q16553	131 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	BSX	Q3C1V8	233 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OR2C3	Q8N628	320 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CLCC1	Q96S66	551 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	HIVEP2	P31629	2446 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394		A0A1W2PN81	502 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	IGSF23	A1L1A6	192 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	C15orf62	A8K5M9	175 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	ARPC5	O15511	151 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	KCNAB3	O43448	404 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	GPR137B	O60478	399 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OPN1MW	P04001	364 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CHRNA7	P36544	502 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OR2F1	Q13607	317 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	PLGLA	Q15195	96 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM86B	Q8N661	226 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	OR4C12	Q96R67	309 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	MFF	Q9GZY8	342 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		9.61	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394		L7N2F9	121 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394		M0QZK8	103 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	VAMP2	P63027	116 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	WT1-AS	Q06250	92 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	FXYD3	Q14802	87 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	STPG2	Q8N412	459 aa		9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
MATR3-231	ENST00000502394	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		9.6	□□□□□ -0.87

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