RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A087WWC5 75 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PPQ1 181 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 J3QW42 95 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLRXP35754 106 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERF2P84101 59 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM90A1Q86YD7 464 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC01560Q8TB33 94 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS25Q9BRG1 176 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCM1Q9NP62 436 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPB7Q9UBY9 170 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN34H7C241 214 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAGE4O60829 102 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMP23AO75900 390 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR12P47775 334 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRGPRGQ86SM5 289 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM18Q96B42 140 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFXN3Q9BWM7 321 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPH3ALQ9UNE2 315 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSMD2Q7Z408 3487 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRRM5B3KS81 715 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LYNX1G3V0Z9 82 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C16orf97H3BN30 126 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 M0R1X1 148 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLAUP00749 431 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFNA1P01562 189 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR9G9P0C7N8 305 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LYNX1P0DP58 116 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBD3L1Q8WWY6 194 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDF2L1Q9HCN8 221 aa12.81□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 M0QZ24 198 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPINT2O43291 252 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PROP1O75360 226 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35E4Q6ICL7 350 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HINT2Q9BX68 163 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUT9Q9Y231 359 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAV3Q8IVL0 2385 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 K7ENP7 123 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRTCAP3Q53RY4 240 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR51G1Q8NGK1 321 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCL17Q92583 94 aa12.8□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGB1BP1O14713 200 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMB3P49720 205 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOMM20LQ6UXN7 152 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM147Q9BVK8 224 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAGKQ9UJ70 344 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAV3A0A0B4J244 114 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMPRSS2O15393 492 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMDQ15546 238 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPCDR1Q9BY65 106 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFP30Q9Y2G7 519 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.79□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN14O95500 239 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPN1MWP04001 364 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPN1MW2P0DN77 364 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPN1MW3P0DN78 364 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LY6HO94772 140 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYOD1P15172 320 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDKN1BP46527 198 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERASQ7Z444 233 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LYG1Q8N1E2 194 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD12Q8N2K0 398 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARLQ9H300 379 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGPEP1LA6NFU8 196 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM241Q24JQ0 296 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GBGT1Q8N5D6 347 aa12.78□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CELSR2Q9HCU4 2923 aa12.77□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C15orf65H3BRN8 121 aa12.77□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRNA7P36544 502 aa12.77□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LY6DQ14210 128 aa12.77□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADIPOQQ15848 244 aa12.77□□□□□ -0.36
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BSXQ3C1V8 233 aa12.77□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa12.77□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4A16Q8NH70 328 aa12.77□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0U1RQK1 487 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM90A26D6RGX4 464 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSMEM1Q8WWF3 244 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGMATQ9BSE5 352 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PMS2P5A8MQ11 134 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RRHO14718 337 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM108Q6UXF1 575 aa12.76□□□□□ -0.37
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIR2DL5AQ8N109 375 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms