RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479566.5

PRKCZ-216, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF585B	Q52M93	769 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	DISC1	C4P0D8	188 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566		H0Y980	276 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	UPK2	O00526	184 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	CSN3	P07498	182 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	PI3	P19957	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	LPAR6	P43657	344 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	RPEL1	Q2QD12	228 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	LCN12	Q6JVE5	192 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	USMG5	Q96IX5	58 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566		E7EUB6	86 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	PRH1	P02810	166 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	PIGP	P57054	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF79	Q15937	498 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	PYDC2	Q56P42	97 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	CADM3	Q8N126	398 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	TRIM63	Q969Q1	353 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	PRRT1	Q99946	306 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566		A0A1B0GW64	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	DPPA5	A6NC42	116 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	HMX3	A6NHT5	357 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	BMPR1B	O00238	502 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	KRAS	P01116	189 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	MYOD1	P15172	320 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	RPA2	P15927	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	G6PC	P35575	357 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	ETV6	P41212	452 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	RHOG	P84095	191 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF45	Q02386	682 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	HAGH	Q16775	308 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566		Q8N402	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	COPZ2	Q9P299	210 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	CGB1	A6NKQ9	187 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR2B8P	P59922	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	RETN	Q9HD89	108 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	IGKV1-39	P01597	117 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	IGKV1D-39	P04432	117 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SERPINE2	P07093	398 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	AREG	P15514	252 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	TATDN3	Q17R31	274 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SEC22A	Q96IW7	307 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	TP53RK	Q96S44	253 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	TSC22D3	Q99576	134 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	TUBA4B	Q9H853	241 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PRKCZ-216	ENST00000479566	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	B3GALNT1	O75752	331 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	SNAPC5	O75971	98 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	CRYGC	P07315	174 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	PSMB6	P28072	239 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	AP3S2	P59780	193 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	MCUB	Q9NWR8	336 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	PEMT	Q9UBM1	199 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	PRND	Q9UKY0	176 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	C15orf61	A6NNL5	157 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PRKCZ-216	ENST00000479566	DHFR	P00374	187 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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