RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	SNCA	P37840	140 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	EBI3	Q14213	229 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	PRSS8	Q16651	343 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	NPB	Q8NG41	125 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	MBD6	Q96DN6	1003 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	CITED4	Q96RK1	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	RAB19	A4D1S5	217 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	PRH1	P02810	166 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAPBP-238	ENST00000475304	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	RRH	O14718	337 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	NBR2	O15453	112 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	NDUFA3	O95167	84 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	CAMLG	P49069	296 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	SSX2	Q16385	188 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	UQCC3	Q6UW78	93 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	NRGN	Q92686	78 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	TNC	P24821	2201 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	PRSS46	E5RG02	174 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	NPFF	O15130	113 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	MB	P02144	154 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304		Q6ZRG5	221 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF709	Q8N972	641 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	C1RL	Q9NZP8	487 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	CA2	P00918	260 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	MMD	Q15546	238 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	RAB2A	P61019	212 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	RUNX1	Q01196	453 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	PLGLA	Q15195	96 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	AANAT	Q16613	207 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	ZNF114	Q8NC26	417 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	RITA1	Q96K30	269 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304		J3QLI3	93 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	FGF7	P21781	194 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	SAA4	P35542	130 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	HES1	Q14469	280 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	TNXA	Q16473	311 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304		A0A1W2PRD5	423 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304		A0A1W2PRF3	423 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304		A0A1W2PRM7	423 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	CORT	O00230	105 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	IGHV1-69	P01742	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	HBE1	P02100	147 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	OPN1MW	P04001	364 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	MYOD1	P15172	320 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TAPBP-238	ENST00000475304	RAB31	Q13636	194 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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