RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	DISC1	C4P0D8	188 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	BMPR1B	O00238	502 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	GP9	P14770	177 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CTRB1	P17538	263 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	ARL3	P36405	182 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	AKR1C2	P52895	323 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM16L	Q309B1	348 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	ASCL2	Q99929	193 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	THYN1	Q9P016	225 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	PRND	Q9UKY0	176 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF320	A2RRD8	509 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	FABP12	A6NFH5	140 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	OR2C1	O95371	312 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CRYGC	P07315	174 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	MEF2D	Q14814	521 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SP6	Q3SY56	376 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM56	Q96MV1	263 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF8	P32971	234 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	FAM209B	Q5JX69	171 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf58	Q96LI9	332 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	MCUB	Q9NWR8	336 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf61	A6NNL5	157 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880		H0Y980	276 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1-39	P01597	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CD74	P04233	296 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV1D-39	P04432	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	GPR183	P32249	361 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	S100A5	P33763	92 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	RND3	P61587	244 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	WT1-AS	Q06250	92 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SPINK9	Q5DT21	86 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TP53RK	Q96S44	253 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	ATG12	O94817	140 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC3B	P05452	202 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	OR5B3	Q8NH48	314 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	SEC22A	Q96IW7	307 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CTDSPL	O15194	276 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA17	P01571	189 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	CSN3	P07498	182 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	FGF2	P09038	288 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	LCN12	Q6JVE5	192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	PLET1	Q6UQ28	207 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	MISP3	Q96FF7	219 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	PRRT1	Q99946	306 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SSR4-208	ENST00000471880	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6

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