RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462712.5

NABP1-208, Transcript of nucleic acid binding protein 1, human

TSL 2

Gene NABP1, Length 961 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NABP1-208	ENST00000462712		H3BUA1	57 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	RAB9A	P51151	201 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	LYG2	Q86SG7	212 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NABP1-208	ENST00000462712	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712		A0A0B4J293	547 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	AREG	P15514	252 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	TPPP2	P59282	170 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	LRTM2	Q8N967	370 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	BRI3	O95415	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	TRGV3	P03979	118 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	PSMB6	P28072	239 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	DHRS2	Q13268	280 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	COQ8A	Q8NI60	647 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	DHFR	P00374	187 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	NMS	Q5H8A3	153 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712		Q6ZRM9	215 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	IFNA17	P01571	189 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	REG1A	P05451	166 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	CRYGC	P07315	174 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	CTRB1	P17538	263 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	PRCD	Q00LT1	54 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712		A0A0G2JLM5	398 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712		A0A1B0GU03	582 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	TSPAN15	O95858	294 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	PRH1	P02810	166 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	DEFA4	P12838	97 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	CYB5B	O43169	146 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	HOXB5	P09067	269 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	SPCS3	P61009	180 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	RHOG	P84095	191 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	SPINK9	Q5DT21	86 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	OR52E5	Q8NH55	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	OR5B12	Q96R08	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	GNB4	Q9HAV0	340 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	ENY2	Q9NPA8	101 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NABP1-208	ENST00000462712	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms