RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448333.1

KCTD3-202, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene KCTD3, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3-202ENST00000448333 CD7P09564 240 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 NAT1P18440 290 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 CBLN1P23435 193 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 POU2AF1Q16633 256 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 HAGHQ16775 308 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 MZT2AQ6P582 158 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 PLET1Q6UQ28 207 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 GPHB5Q86YW7 130 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 GPX8Q8TED1 209 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 NEURL2Q9BR09 285 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 COMMD9Q9P000 198 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.29□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 A8MZ25 164 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 M0QYG6 137 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 LGALS9O00182 355 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 IFNA6P05013 189 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 LYL1P12980 280 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 PGAM2P15259 253 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 ZNF585BQ52M93 769 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 TM4SF20Q53R12 229 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 GPR107Q5VW38 600 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 LPCAT3Q6P1A2 487 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 DEFB125Q8N687 156 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 CMTM3Q96MX0 182 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 SPATA25Q9BR10 227 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
KCTD3-202ENST00000448333 OR2T8A6NH00 312 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 OR11H12B2RN74 326 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 SERPINE2P07093 398 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 RCVRNP35243 200 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 WT1-ASQ06250 92 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 CASC10Q5T4H9 136 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 BTNL8Q6UX41 500 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 OR4A16Q8NH70 328 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 AP3S1Q92572 193 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 CITED4Q96RK1 184 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 RETNQ9HD89 108 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 KLK11Q9UBX7 282 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 PRNDQ9UKY0 176 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 TMEM213A2RRL7 107 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 DBX1A6NMT0 343 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 RGS5O15539 181 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 TGOLN2O43493 480 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 PI3P19957 117 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 CTF1Q16619 201 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 Q56UQ5 140 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 LAX1Q8IWV1 398 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 ISOC1Q96CN7 298 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 TMEM56Q96MV1 263 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 TSC22D3Q99576 134 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 MLXQ9UH92 298 aa7.26□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 TENM3Q9P273 2699 aa7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 CD3DP04234 171 aa7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 SMIM18P0DKX4 95 aa7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 MFAP2P55001 183 aa7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 KLK9Q2XQG4 91 aa7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 SPINK9Q5DT21 86 aa7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
KCTD3-202ENST00000448333 GPR141Q7Z602 305 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms