RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442691.6

NR1I3-211, Transcript of nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NR1I3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3-211ENST00000442691 RAB11AP62491 216 aa7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF114Q8NC26 417 aa7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 ATP5SQ99766 215 aa7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.28□□□□□ -1.24
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SLC25A17O43808 307 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 MPDU1O75352 247 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 ACTL6BO94805 426 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 FSHBP01225 129 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SEC11BP0C7V7 166 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 IAPPP10997 89 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 RAB5CP51148 216 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 DLX1P56177 255 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 MMDQ15546 238 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SSX2Q16385 188 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 VWC2Q2TAL6 325 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 C2orf83Q53S99 150 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 Q96MF0 132 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 GINS3Q9BRX5 216 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.27□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 C15orf62A8K5M9 175 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 H3BS24 57 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 M0QZK8 103 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 CORTO00230 105 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 FGF16O43320 207 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 IFNA5P01569 189 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 IGKV1D-33P01593 117 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 IGKV1-33P01594 117 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 HLA-DRB1P01911 266 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 NPY1RP25929 384 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 RAB14P61106 215 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 DLK1P80370 383 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 NHLH2Q02577 135 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 CLLU1Q5K131 121 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 OR1L6Q8NGR2 347 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 CCDC140Q96MF4 163 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 OR4C12Q96R67 309 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 ARID1AO14497 2285 aa7.26□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 UMAD1C9J7I0 102 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 PRSS46E5RG02 174 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 TRIM77I1YAP6 450 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 TGFAP01135 160 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 IFNA10P01566 189 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SPP1P10451 314 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 FOSL1P15407 271 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM11P17152 192 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SNCAP37840 140 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 NANPQ8TBE9 248 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 TMEM68Q96MH6 324 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 MED9Q9NWA0 146 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 SPG11Q96JI7 2443 aa7.25□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 AKAP6Q13023 2319 aa7.24□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.24□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 H3BP45 60 aa7.24□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 CYB5BO43169 146 aa7.24□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 KCNAB3O43448 404 aa7.24□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 CST7O76096 145 aa7.24□□□□□ -1.25
NR1I3-211ENST00000442691 NXPH3O95157 252 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms