RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428527.1

TTC27-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

TSL 3

Gene TTC27, Length 687 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-202ENST00000428527 ATG5Q9H1Y0 275 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 TUBA4BQ9H853 241 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 RASL12Q9NYN1 266 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ATPIF1Q9UII2 106 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 V9GYS6 101 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 GPR179Q6PRD1 2367 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 COL4A2P08572 1712 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 PTPRSQ13332 1948 aa2.76□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 KNL1Q8NG31 2342 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 BRCA2P51587 3418 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 TVP23AA6NH52 213 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 SLC22A20A6NK97 555 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 LYRM9A8MSI8 78 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ZNF878C9JN71 531 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 XRCC2O43543 280 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 SFT2D2O95562 160 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 HBE1P02100 147 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 MT-ND4P03905 459 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 COX5BP10606 129 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 GTF2F2P13984 249 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 DNASE1L1P49184 302 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 GFERP55789 205 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CLDN6P56747 220 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 TSPAN5P62079 268 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 FAM3AP98173 230 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 DHRS2Q13268 280 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 PLPPR5Q32ZL2 321 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CHRFAM7AQ494W8 412 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 C3orf33Q6P1S2 294 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 DCXRQ7Z4W1 244 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 DPPA2Q7Z7J5 298 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 LYG2Q86SG7 212 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ZIC4Q8N9L1 334 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 PXT1Q8NFP0 134 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 OR51A4Q8NGJ6 313 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 DOK4Q8TEW6 326 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 TSLPQ969D9 159 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 SLAMF6Q96DU3 332 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 GALNT14Q96FL9 552 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ARL5BQ96KC2 179 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 PHB2Q99623 299 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 GINS4Q9BRT9 223 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 BEX2Q9BXY8 128 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 LINC00470Q9BZP3 86 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 LPAR5Q9H1C0 372 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ARV1Q9H2C2 271 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 PROK2Q9HC23 129 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 COMMD9Q9P000 198 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 WIF1Q9Y5W5 379 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa2.75□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 A0A1B0GW64 132 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 A0A1W2PRF3 423 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 A0A1W2PRM7 423 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 F6UB75 175 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 MFNGO00587 321 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 RP2O75695 350 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 MPZL1O95297 269 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 IFNA6P05013 189 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CRHP06850 196 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CST2P09228 141 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CTXN2P0C2S0 81 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ZNF250P15622 560 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CNR1P21554 472 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 DTYMKP23919 212 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 NPY1RP25929 384 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 PAX6P26367 422 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 RFC3P40938 356 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 KCNJ3P48549 501 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 RAB5CP51148 216 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CLDN12P56749 244 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 MLF1P58340 268 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 PCBD1P61457 104 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 UBA52P62987 128 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 CCL7P80098 99 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 ZNF92Q03936 586 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 OR7A5Q15622 319 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 KISS1Q15726 138 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 SGCAQ16586 387 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 DEFB133Q30KQ1 61 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 DEFB110Q30KQ9 67 aa2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
TTC27-202ENST00000428527 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms