RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RNF5Q99942 180 aa9.02□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.02□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.02□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.02□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CYB5BO43169 146 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CA2P00918 260 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 HTR1DP28221 377 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 BTN1A1Q13410 526 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 KHDC3LQ587J8 217 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MMD2Q8IY49 270 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PNKDQ8N490 385 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TEX45Q8NA69 505 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OR10G4Q8NGN3 311 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ACTL6BO94805 426 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 IGLV2-23P01705 113 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PRTN3P24158 256 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MAS1LP35410 378 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OPRK1P41145 380 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PMS2P11Q13670 270 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 GUCA2BQ16661 112 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 BSXQ3C1V8 233 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ACSM6Q6P461 480 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TEPPQ6URK8 271 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 LCN15Q6UWW0 184 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MOB3BQ86TA1 216 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CLDND2Q8NHS1 167 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 VSIRQ9H7M9 311 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TNCP24821 2201 aa9□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SLC25A17O43808 307 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV2-5P01817 119 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 BCL2P10415 239 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ARF6P62330 175 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 HAGHQ16775 308 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 Q8N7P7 452 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 P2RX4Q99571 388 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 DPM3Q9P2X0 92 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 KALRNO60229 2985 aa8.99□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OOSP1A8MZH6 123 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 C9JQL5 133 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 LY6LH3BQJ8 138 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OVOL3O00110 214 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TSPAN9O75954 239 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OPN1MWP04001 364 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 PDLIM4P50479 330 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CCL20P78556 96 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF726P1Q15940 193 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MANBALQ9NQG1 85 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SIRT7Q9NRC8 400 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 GNG13Q9P2W3 67 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.98□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PPV4 95 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ZFP92A6NM28 416 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ODF3BA8MYP8 253 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 IGKV1D-33P01593 117 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 IGKV1-33P01594 117 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MYOD1P15172 320 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 HNF4GQ14541 408 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 ICAM4Q14773 271 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SLC35E1Q96K37 410 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 CCL19Q99731 98 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 MGST2Q99735 147 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.97□□□□□ -0.97
CTXN3-202ENST00000395322 SLC25A22Q9H936 323 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms