RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 IFNA6P05013 189 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CT45A6P0DMU7 189 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CT45A5P0DMU8 189 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CT45A7P0DMV0 189 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SPNP16150 400 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SRMP19623 302 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 HTR2CP28335 458 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CEACAM6P40199 344 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 LGALS7P47929 136 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TPPP2P59282 170 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CBX3Q13185 183 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 HMGN3Q15651 99 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 LYPD6Q86Y78 171 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 LFNGQ8NES3 379 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SETD6Q8TBK2 473 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ARPC1AQ92747 370 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PGLYRP3Q96LB9 341 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 MS4A10Q96PG2 267 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CENPOQ9BU64 300 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 MND1Q9BWT6 205 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 VCXQ9H320 206 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 FBXL15Q9H469 300 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 H0YJW9 148 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 FCN1O00602 326 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SOX15O60248 233 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV3-11P01762 117 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 AADACP22760 399 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SERPINB10P48595 397 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PSMD7P51665 324 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 NDPQ00604 133 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TPBGQ13641 420 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 FXYD3Q14802 87 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PSG5Q15238 335 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TRAM1Q15629 374 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 RNLSQ5VYX0 342 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR10K2Q6IF99 312 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 AHSA2Q719I0 299 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PDPNQ86YL7 162 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 POC5Q8NA72 575 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PTX4Q96A99 478 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ISOC1Q96CN7 298 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CMTM3Q96MX0 182 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 CLCC1Q96S66 551 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 AGMATQ9BSE5 352 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TMED9Q9BVK6 235 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TM2D1Q9BX74 207 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 TUBA4BQ9H853 241 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 SCN3BQ9NY72 215 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-204ENST00000367379 A0A0B4J203 849 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM14DPA8MWL7 114 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TRDCB7Z8K6 153 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 PTGES3LE9PB15 166 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 AIREO43918 545 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 ARL6IP5O75915 188 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 TPPPO94811 219 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 BRI3O95415 125 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 DIRAS3O95661 229 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CA2P00918 260 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 IGLV1-51P01701 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CDK1P06493 297 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 CD3GP09693 182 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 RRASP10301 218 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 HLA-DRB3P79483 266 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 P2RY14Q15391 338 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 SPHARQ15513 63 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-204ENST00000367379 RAB11BQ15907 218 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms