RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC144AA2RUR9 1427 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGS12O14924 1447 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCCP43146 1447 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF532Q9HCE3 1301 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSNP26038 577 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CEBPGP53567 150 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM258P61165 79 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 HBA1P69905 142 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLT8D1Q68CQ7 371 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 C9orf163Q8N9P6 203 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM106BQ9NUM4 274 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXL12Q9NXK8 326 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 MPDZO75970 2070 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 GBF1Q92538 1859 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUP160Q12769 1436 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 FLT4P35916 1363 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMIM23A6NLE4 172 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 ORC5O43913 435 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV3-7P01780 117 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1QCP02747 245 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SHBGP04278 402 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERPINA7P05543 415 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 UCHL1P09936 223 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTXN2P0C2S0 81 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRGC1P0CF51 173 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SULT1A3P0DMM9 295 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SULT1A4P0DMN0 295 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD79AP11912 226 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 HAAOP46952 286 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 OMPP47874 163 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 ERVS71-1P61550 626 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 AP1S1P61966 158 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 GLO1Q04760 184 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 RGS21Q2M5E4 152 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM173BQ6P4H8 233 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 Q6ZS49 121 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR8B12Q8NGG6 310 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 ROPN1LQ96C74 230 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCUN1D1Q96GG9 259 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSPB9Q9BQS6 159 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 DERL1Q9BUN8 251 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM147Q9BVK8 224 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CYSLTR1Q9Y271 337 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAST2Q6P0Q8 1798 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 ROBO3Q96MS0 1386 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 HMSDA8MTL9 139 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATP5HO75947 161 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 S1PR2O95136 353 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT75O95678 551 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRYZL1O95825 349 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 IFNA6P05013 189 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMIM17P0DL12 118 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRYGAP11844 174 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SERPINB9P50453 376 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 PSME3P61289 254 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCL20P78556 96 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKR1C1Q04828 323 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 FADDQ13158 208 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 STX5Q13190 355 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CDK10Q15131 360 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 MOGQ16653 247 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPOPLQ6IQ16 392 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 C20orf196Q8IYI0 205 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 C15orf53Q8NAA6 179 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 DCSTAMPQ9H295 470 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPRSQ13332 1948 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 BAHCC1Q9P281 2608 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 ITGB4P16144 1822 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 FABP5P3A8MUU1 101 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 FADS1O60427 444 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CIAO1O76071 339 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTRP02766 147 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 UBBP0CG47 229 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CCL7P80098 99 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-487P-201ENST00000365430 CAV1Q03135 178 aa0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms