RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 IL4P05112 153 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-201ENST00000345716 TFPI2P48307 235 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-201ENST00000345716 CENPWQ5EE01 88 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-201ENST00000345716 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-201ENST00000345716 OR4C5Q8NGB2 326 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-201ENST00000345716 GPR61Q9BZJ8 451 aa17.35■□□□□ 0.37
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NISCH-201ENST00000345716 KIAA1644Q3SXP7 199 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 SPACA3Q8IXA5 215 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 J3QR89 54 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 IGKV1D-33P01593 117 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 IGKV1-33P01594 117 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 TM4SF20Q53R12 229 aa17.32■□□□□ 0.36
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NISCH-201ENST00000345716 CCL19Q99731 98 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 RAXQ9Y2V3 346 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 NOTCH4Q99466 2003 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 CD55P08174 381 aa17.31■□□□□ 0.36
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NISCH-201ENST00000345716 UPK2O00526 184 aa17.31■□□□□ 0.36
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NISCH-201ENST00000345716 CA7P43166 264 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 RELBQ01201 579 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 SRIP30626 198 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 DUTP33316 252 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 S4R3C0 116 aa17.3■□□□□ 0.36
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NISCH-201ENST00000345716 SCGB1C2P0DMR2 95 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 CACNG8Q8WXS5 425 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 E9PQ18 207 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 TANC1Q9C0D5 1861 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 SRRM5B3KS81 715 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 GCGP01275 180 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 C15orf61A6NNL5 157 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 CKS2P33552 79 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 EBLN2Q6P2I7 272 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 SCO2A0A1W2PP80 73 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 MAS1LP35410 378 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa17.29■□□□□ 0.36
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NISCH-201ENST00000345716 PSPNO60542 156 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 NAPSAO96009 420 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 MIR17HGQ75NE6 70 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 POLEQ07864 2286 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 GRIFINA4D1Z8 144 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 LILRA1O75019 489 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 NPPCP23582 126 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 RAB9AP51151 201 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 CACNA1GO43497 2377 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 IFITM10A6NMD0 228 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-201ENST00000345716 M0QZK8 103 aa17.27■□□□□ 0.36
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