RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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HOXD8-201ENST00000313173 RPEQ96AT9 228 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD8-201ENST00000313173 SMDT1Q9H4I9 107 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD8-201ENST00000313173 SMCO3A2RU48 225 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD8-201ENST00000313173 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
HOXD8-201ENST00000313173 SIRT7Q9NRC8 400 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXD8-201ENST00000313173 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
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HOXD8-201ENST00000313173 IGHV2-5P01817 119 aa21.64■■□□□ 1.05
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HOXD8-201ENST00000313173 TREML4Q6UXN2 200 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 MOB3BQ86TA1 216 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 KIR3DL3Q8N743 410 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 INS-IGF2F8WCM5 200 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN9O75954 239 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1D-33P01593 117 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1-33P01594 117 aa21.63■■□□□ 1.05
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HOXD8-201ENST00000313173 BSXQ3C1V8 233 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 SSX7Q7RTT5 188 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 RITA1Q96K30 269 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 KPTNQ9Y664 436 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A17O43808 307 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF787Q6DD87 383 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 SOX15O60248 233 aa21.62■■□□□ 1.05
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HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PN81 502 aa21.61■■□□□ 1.05
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HOXD8-201ENST00000313173 CHRNA7P36544 502 aa21.61■■□□□ 1.05
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HOXD8-201ENST00000313173 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 OR10W1Q8NGF6 305 aa21.61■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35B3Q9H1N7 401 aa21.61■■□□□ 1.05
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HOXD8-201ENST00000313173 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXD8-201ENST00000313173 SNAPINO95295 136 aa21.6■■□□□ 1.05
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HOXD8-201ENST00000313173 E7EUB6 86 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV4-39P01824 125 aa21.58■■□□□ 1.04
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HOXD8-201ENST00000313173 OPRK1P41145 380 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD8-201ENST00000313173 KLRD1Q13241 179 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD8-201ENST00000313173 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
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HOXD8-201ENST00000313173 MMD2Q8IY49 270 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf159Q96HA4 380 aa21.57■■□□□ 1.04
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HOXD8-201ENST00000313173 KCNIP2Q9NS61 270 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD8-201ENST00000313173 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXD8-201ENST00000313173 PRSS8Q16651 343 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD8-201ENST00000313173 KHDC3LQ587J8 217 aa21.56■■□□□ 1.04
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HOXD8-201ENST00000313173 GNG13Q9P2W3 67 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD8-201ENST00000313173 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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