RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299543.8

CTDP1-202, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CTDP1, Length 3,380 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-202ENST00000299543 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
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CTDP1-202ENST00000299543 TMEM238C9JI98 176 aa11.17□□□□□ -0.62
CTDP1-202ENST00000299543 CLDN14O95500 239 aa11.17□□□□□ -0.62
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CTDP1-202ENST00000299543 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.15□□□□□ -0.62
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CTDP1-202ENST00000299543 C15orf62A8K5M9 175 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.13□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 H0Y8G0 127 aa11.13□□□□□ -0.63
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CTDP1-202ENST00000299543 NPPCP23582 126 aa11.12□□□□□ -0.63
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CTDP1-202ENST00000299543 AGMATQ9BSE5 352 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 K7EP13 123 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF134P52741 427 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 IL19Q9UHD0 177 aa11.12□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.11□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM250H0YL14 139 aa11.11□□□□□ -0.63
CTDP1-202ENST00000299543 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.11□□□□□ -0.63
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