RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZRM9 215 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 OR52B4Q8NGK2 314 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 PHB2Q99623 299 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 TMED3Q9Y3Q3 217 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 H3BUA1 57 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 PRAF2O60831 178 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 CD28P10747 220 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 CACNG5Q9UF02 275 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 ANK2Q01484 3957 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 HMX3A6NHT5 357 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 NPIPB5A8MRT5 1133 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 ST8SIA3O43173 380 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 CRYGCP07315 174 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 SULT1A3P0DMM9 295 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 SULT1A4P0DMN0 295 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A6P12236 298 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 SPNP16150 400 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 PRCDQ00LT1 54 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 OR52E5Q8NH55 327 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 SEC22CQ9BRL7 303 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 CACFD1Q9UGQ2 172 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GU03 582 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 INS-IGF2F8WCM5 200 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 DHFRP00374 187 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 HOXB5P09067 269 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 APELAP0DMC3 54 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 AREGP15514 252 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 CTRB1P17538 263 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 PSMB6P28072 239 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 SMCO1Q147U7 214 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 RGS21Q2M5E4 152 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 KLK9Q2XQG4 91 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 GGNBP1Q5YKI7 109 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 OR5T1Q8NG75 326 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 PDCD10Q9BUL8 212 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 ZFP57Q9NU63 452 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 DNHD1Q96M86 4753 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 SNRPGP15A8MWD9 76 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 PITX3O75364 302 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 ADAP1O75689 374 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 PF4V1P10720 104 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 RAB9AP51151 201 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 SPCS3P61009 180 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 WT1-ASQ06250 92 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFA11Q86Y39 141 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 OR10W1Q8NGF6 305 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 HINT2Q9BX68 163 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 KLK15Q9H2R5 256 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA21P01568 189 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 IFNA17P01571 189 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM65Q6PI78 240 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 HSPB7Q9UBY9 170 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 WNK1Q9H4A3 2382 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 C7orf66A4D0T2 115 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 FAM90A26D6RGX4 464 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 OR13C7P0DN81 318 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 OXA1LQ15070 435 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 OR2C3Q8N628 320 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF491Q8N8L2 437 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF114Q8NC26 417 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2E2Q96LR5 201 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 MPTX1A8MV57 137 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 TRGV3P03979 118 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 REG1AP05451 166 aa10.29□□□□□ -0.76
CCDC42-201ENST00000293845 TPPP2P59282 170 aa10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms