RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ISLRO14498 428 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PMCHP20382 165 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CFHR2P36980 270 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CSN1S1P47710 185 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 STARD4Q96DR4 205 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 AMBPP02760 352 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IGFBP2P18065 325 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 AMTP48728 403 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C2orf83Q53S99 150 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MOB3BQ86TA1 216 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MGST2Q99735 147 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OSTCQ9NRP0 149 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 KLK10O43240 276 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IGLV1-44P01699 117 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OR4A8P0C604 315 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 NTF3P20783 257 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 EFNB3Q15768 340 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 VAMP3Q15836 100 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZPA2 131 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CCL17Q92583 94 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PRE2 83 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 LINC00869P0C866 280 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CD40P25942 277 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TIMP3P35625 211 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CENPWQ5EE01 88 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TEX38Q6PEX7 206 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GRAMD2BQ96HH9 432 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GFRA3O60609 400 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CT45A10P0DMU9 189 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CRYBB3P26998 211 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 LRP11Q86VZ4 500 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OR9G1Q8NH87 305 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C15orf65H3BRN8 121 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RRHO14718 337 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TCAPO15273 167 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PRR27Q6MZM9 219 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RPEQ96AT9 228 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 METRNQ9UJH8 293 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CACNA1EQ15878 2313 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 PI4KAP42356 2102 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TNXAQ16473 311 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 HYPMO75409 117 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CD3EP07766 207 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 GATA4P43694 442 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CGAP01215 116 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IGLV2-14P01704 120 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C1QTNF9P0C862 333 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 EGR1P18146 543 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 SSX7Q7RTT5 188 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 NUP37Q8NFH4 326 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RND1Q92730 232 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 LEAP2Q969E1 77 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1D-33P01593 117 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-33P01594 117 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 P01737 135 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 ORM2P19652 201 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM3P40198 252 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 TMPRSS3P57727 454 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 C11orf53Q8IXP5 236 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 OCC1Q8TAD7 63 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 DIRC3C9JPN6 131 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-201ENST00000264345 CD69Q07108 199 aa7.31□□□□□ -1.24
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