RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	RARRES2	Q99969	163 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	PLXNB2	O15031	1838 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	ICAM4	Q14773	271 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	NEU1	Q99519	415 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	PARL	Q9H300	379 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	JKAMP	Q9P055	326 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ARID1B-223	ENST00000637015	C7orf71	A4D174	169 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	LINC01549	A6NIU2	74 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	C12orf77	C9JDV5	145 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TGFA	P01135	160 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	NMB	P08949	121 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM27E3	Q08E93	113 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TNFRSF14	Q92956	283 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TRGC2	P03986	189 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	NPBWR2	P48146	333 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	CENPW	Q5EE01	88 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	HOXA5	P20719	270 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	LINC01587	Q99440	93 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015		C9JCJ5	164 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	NUDT11	Q96G61	164 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	ASCL2	Q99929	193 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	FBXL15	Q9H469	300 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	SCN4A	P35499	1836 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	NBR2	O15453	112 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	CD5	P06127	495 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	SPRED2	Q7Z698	418 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015		E9PLN8	166 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	PIN1P1	O15428	100 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF250	P15622	560 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	CNTFR	P26992	372 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	UCP1	P25874	307 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	EGR4	Q05215	589 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	WDR82	Q6UXN9	313 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	C4orf51	C9J302	202 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	PEX7	O00628	323 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	KLF4	O43474	513 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	CD8A	P01732	235 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	STH	Q8IWL8	128 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	VCX2	Q9H322	139 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A1B0GUT8	65 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015		A1L4Q6	167 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TTC32	Q5I0X7	151 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	AICDA	Q9GZX7	198 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	SMIM13	P0DJ93	91 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	CACNG7	P62955	275 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	CFHR1	Q03591	330 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TIAF1	O95411	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	YPEL1	O60688	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	GPR183	P32249	361 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TBR1	Q16650	682 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	PSMB11	A5LHX3	300 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	CRYBA2	P53672	197 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-223	ENST00000637015	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		10.43	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154 ms