RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612708.4

SLC1A3-215, Transcript of solute carrier family 1 member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SLC1A3, Length 3,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC1A3-215	ENST00000612708	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	HELT	A6NFD8	242 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708		J3QT63	122 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708		M0R2Z0	102 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	CCL25	O15444	150 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	OR7C2	O60412	319 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	NTF4	P34130	210 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708		Q8NFD4	153 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	TECTA	O75443	2155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SLC1A3-215	ENST00000612708	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	FCGR3B	O75015	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	CLDN14	O95500	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	APCS	P02743	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	WNT2	P09544	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	TNFSF4	P23510	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	CCL7	P80098	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	GUSBP11	Q6P575	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	CDIPT	O14735	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	RAB29	O14966	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	MPDU1	O75352	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	GCHFR	P30047	84 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	ARR3	P36575	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708		Q0VG73	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	NEURL1	O76050	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	FOLR3	P41439	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	GPR12	P47775	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	LGALS4	P56470	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	PSG5	Q15238	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	COX19	Q49B96	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708		H0Y8G0	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	CRYBB3	P26998	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	TSPO	P30536	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708		Q8IYB0	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708		A0A0G2JMM0	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708		A0A1W2PPB8	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708		A0A1W2PRS3	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708		A0A1W2PS18	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	HBZ	P02008	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	AMY1A	P04745	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLC1A3-215	ENST00000612708	S100A7	P31151	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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