RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597618.5

TRIM28-210, Transcript of tripartite motif containing 28, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM28, Length 609 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28-210ENST00000597618 TMEM187Q14656 261 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRIM28-210ENST00000597618 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.39□□□□□ -1.23
TRIM28-210ENST00000597618 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRIM28-210ENST00000597618 RNF126Q9BV68 326 aa7.39□□□□□ -1.23
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TRIM28-210ENST00000597618 FAM231CP0DMU5 169 aa7.38□□□□□ -1.23
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TRIM28-210ENST00000597618 SMPXQ9UHP9 88 aa7.35□□□□□ -1.23
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TRIM28-210ENST00000597618 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM28-210ENST00000597618 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM28-210ENST00000597618 CHEK1O14757 476 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM28-210ENST00000597618 CTXN2P0C2S0 81 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM28-210ENST00000597618 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRIM28-210ENST00000597618 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.34□□□□□ -1.23
TRIM28-210ENST00000597618 PAFAH1B2P68402 229 aa7.34□□□□□ -1.23
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