RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SCGB1C1Q8TD33 95 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP5SQ99766 215 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM3Q9BZL3 60 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP26Q9NRE1 261 aa18.3■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TACC2O95359 2948 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNA10P01566 189 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 OR8U8P0C7N1 319 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 HTR2BP41595 481 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CLLU1Q5K131 121 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01356Q8N9X3 169 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 OR5C1Q8NGR4 320 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 OR2T10Q8NGZ9 312 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CYTL1Q9NRR1 136 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 AUP1Q9Y679 476 aa18.29■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC168Q8NDH2 2452 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 J3QLI3 93 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CST7O76096 145 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MOSP00540 346 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.523e-6■■■□□ 17
CAPNS1-212ENST00000591041 ERHP84090 104 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PRCDQ00LT1 54 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 NHLH2Q02577 135 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KLRD1Q13241 179 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PDZD9Q8IXQ8 264 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF141Q8WVD5 230 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 NRGNQ92686 78 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf159Q96HA4 380 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TBX15Q96SF7 602 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 HILPDAQ9Y5L2 63 aa18.28■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PDZD2O15018 2839 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PPI3 338 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 H3BP45 60 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMM23O14925 209 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM50AO95807 157 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM106CPP0CH98 169 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 DYNLT3P51808 116 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PLGLAQ15195 96 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 HCP5Q6MZN7 132 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GGACTQ9BVM4 153 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 C1RLQ9NZP8 487 aa18.27■□□□□ 0.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFHX3Q15911 3703 aa18.27■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC11BP0C7V7 166 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL15P1P0C7V9 234 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SNCAP37840 140 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB5CP51148 216 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CLINT1Q14677 625 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM217Q8N7C4 229 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 HINT2Q9BX68 163 aa18.26■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NPFFO15130 113 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A17O43808 307 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CFDP00746 253 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC38A11Q08AI6 406 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SSX2Q16385 188 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 GINS3Q9BRX5 216 aa18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 INS-IGF2F8WCM5 200 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 VENTXO95231 258 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 BPIFB3P59826 476 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 HES1Q14469 280 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PSG5Q15238 335 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 Q5PR19 223 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ZDHHC16Q969W1 377 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ARV1Q9H2C2 271 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 HIVEP1P15822 2718 aa18.24■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV3A0A0B4J244 114 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NPY1RP25929 384 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 COMPP49747 757 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 DLX1P56177 255 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 THNSL2Q86YJ6 484 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TEX29Q8N6K0 151 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PFDN2Q9UHV9 154 aa18.23■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 DCHS2Q6V1P9 2916 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 UMAD1C9J7I0 102 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NBR2O15453 112 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SOX15O60248 233 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV2-23P01705 113 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV1-69P01742 117 aa18.22■□□□□ 0.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNA4P05014 189 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms