RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ORM1P02763 201 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 ADMP35318 185 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 HES3Q5TGS1 186 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 NABP1Q96AH0 204 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV2-5P01817 119 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 COX7A1P24310 79 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 Q1RN00 199 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 AHRRA9YTQ3 701 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PPIAL4DF5H284 164 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 EFNA2O43921 213 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 CGAP01215 116 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 IGHV2-70P01814 119 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 C1QTNF9P0C862 333 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 TMEM42Q69YG0 159 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TEX38Q6PEX7 206 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 GFRALQ6UXV0 394 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 VOPP1Q96AW1 172 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.74□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZT83 130 aa8.73□□□□□ -1.01
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PTPRM-205ENST00000577827 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 DLEU1O43261 78 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 IGFBP2P18065 325 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01551Q86U37 167 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-205ENST00000577827 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.73□□□□□ -1.01
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