RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568514.5

SNAP23-218, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 3

Gene SNAP23, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-218	ENST00000568514	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	DIABLO	Q9NR28	239 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	CALY	Q9NYX4	217 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	DPM3	Q9P2X0	92 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	DUX4	Q9UBX2	424 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	MLX	Q9UH92	298 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	RAB22A	Q9UL26	194 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SNAP23-218	ENST00000568514	AKAP6	Q13023	2319 aa		2.59	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		2.59	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		A0A096LNT2	108 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SERPINE3	A8MV23	424 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		J3QRE1	110 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		J3QRK9	145 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		M0QZK8	103 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	BET1	O15155	118 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RGS5	O15539	181 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IGLV3-1	P01715	115 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RBP4	P02753	201 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FCGR3A	P08637	254 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	VDAC1	P21796	283 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ZBTB25	P24278	435 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	KIR2DS4	P43632	304 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	P2RY1	P47900	373 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	REG1B	P48304	166 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RAB7A	P51149	207 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC35A2	P78381	396 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PITPNA	Q00169	270 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	KIR2DS1	Q14954	304 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PHC2	Q8IXK0	858 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FGFRL1	Q8N441	504 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	UBALD1	Q8TB05	177 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	LEAP2	Q969E1	77 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TBX15	Q96SF7	602 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	PHB2	Q99623	299 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ESM1	Q9NQ30	184 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	IL36G	Q9NZH8	169 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OPN4	Q9UHM6	478 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ARID1A	O14497	2285 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	APC	P25054	2843 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		2.58	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ROS1	P08922	2347 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514		A0A1W2PPE3	182 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	OOSP1	A8MZH6	123 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	SLC17A2	O00624	439 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	HSD17B6	O14756	317 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	RAB29	O14966	203 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CYB5B	O43169	146 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	GPX5	O75715	221 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	CNIH1	O95406	144 aa		2.57	□□□□□ -2
SNAP23-218	ENST00000568514	LALBA	P00709	142 aa		2.57	□□□□□ -2

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