RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554956.5

PSMC6-208, Transcript of proteasome 26S subunit, ATPase 6, human

TSL 3

Gene PSMC6, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMC6-208	ENST00000554956	EBI3	Q14213	229 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	HES1	Q14469	280 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	KISS1	Q15726	138 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	C15orf32	Q32M92	178 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	XAF1	Q6GPH4	301 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956		Q6ZR54	194 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	TMEM104	Q8NE00	496 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	RPE	Q96AT9	228 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	C10orf35	Q96D05	121 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	NEK6	Q9HC98	313 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	AMBN	Q9NP70	447 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956		U3KQK5	164 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	DAPL1	A0PJW8	107 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956		M0QZK8	103 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	GABRP	O00591	440 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	NBR2	O15453	112 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	FGF16	O43320	207 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	CDRT1	O95170	752 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	CLIC3	O95833	236 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	CYB5A	P00167	134 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	HTR1A	P08908	422 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	FAS	P25445	335 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	MADCAM1	Q13477	382 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	KIR2DS1	Q14954	304 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	ZNF691	Q5VV52	312 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	ASCL4	Q6XD76	172 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	MOB3B	Q86TA1	216 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	CHST4	Q8NCG5	386 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	RAB3C	Q96E17	227 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	ABCG5	Q9H222	651 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	GLS2	Q9UI32	602 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	AP4S1	Q9Y587	144 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PSMC6-208	ENST00000554956	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	FUOM	A2VDF0	154 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956		G3V318	75 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	CCRL2	O00421	344 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	HSD17B6	O14756	317 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	SULT1B1	O43704	296 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	MT-ND4	P03905	459 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	HSMCR30	P0CW71	290 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	CNTFR	P26992	372 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	PSMB8	P28062	276 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	RAB7A	P51149	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	PAX5	Q02548	391 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	TMED1	Q13445	227 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	CASC10	Q5T4H9	136 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	LINC00311	Q8N616	119 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	PXT1	Q8NFP0	134 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PSMC6-208	ENST00000554956	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81

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